De acuerdo con las primeras versiones, López Aquino fue asesinado por dos jóvenes que llegaron a su domicilio a bordo de una motocicleta. Recibió tres impactos de bala en el tórax y uno más en la cabeza.
La presidenta municipal de Ixhuatán, Olivia Matus, del Partido Revolucionario Institucional (PRI), se dijo consternada por el asesinato de su secretario municipal y pidió que las autoridades esclarezcan los hechos y castiguen a los responsables.
La comunidad zapoteca de San Francisco Ixhuatán se localiza en zona oriente del Istmo de Tehuantepec, a unos 400 kilómetros al sureste de la capital de Oaxaca.
